南阳医圣祠现存有一通“灵应碑”，该碑记载了医圣祠鲜为人知的始建过程。

       说明朝崇祯元年（1628年）四月，兰考廪生（廪lǐn，米仓。廪生，明清两代称由公家给以膳食的生员，又称廪膳生。）冯应鳌染上了伤寒，病情沉重，几乎不治。至12日午夜，突然有一黄衣金冠的神人来到病床前，以手抚之，冯“百节俱活”。于是他问是哪位神人救了自己，神人告诉他：我是汉长沙太守南阳张仲景，我救活你是千古奇事；我也有千古憾事，你可以为我弥补。南阳府东四里许有庙，庙后七十七步有冢，岁久湮没，荡为平地，重起墓冢就靠你了。说完，神人就不见了。

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       冯应鳌并不知道张仲景是谁，一问之下，才知道是医门的圣人。他病愈后不远千里从兰考赶到南阳，在城东果然看到一座庙，庙内的十代名医像中有一个宛然就是他梦中见到的神人，拂去尘土，看到画像下是张仲景的名字。冯应鳌向父老询问，得知庙后原来确实有古冢和石碑，相传明初指挥使郭云修建府邸时推倒了石碑，后来这里就成了菜地。冯找到这块地的主人祝家说明情况，要求买下原墓冢附近的地。但祝家觉得他的说法太荒诞，菜地共有40亩，他只买其中的一小块很生气，坚决不答应。冯应鳌没办法，就刻了块“灵应碑”记述他的故事，然后离开了南阳。

       几年后，祝家打井时挖出来一块石碑，上面写着“汉长沙太守医圣张仲景墓”字样，打井时还出现了种种怪异的事情。于是这事的前前后后就传开了，人们都相信了冯应鳌的说法，并自发地为张仲景重修墓冢及其祠堂。而通过科举考试成为叶县训导的冯应鳌也再度来拜，并重刻了一块灵应碑。